Penápolis är en ort i Brasilien. Den ligger i kommunen Penápolis och delstaten São Paulo, i den södra delen av landet, 700 km söder om huvudstaden Brasília. Penápolis ligger 414 meter över havet och antalet invånare är 54,477.
Terrängen runt Penápolis är platt. Den högsta punkten i närheten är 439 meter över havet, 1.1 km söder om Penápolis. Penápolis är det största samhället i trakten.
Runt Penápolis är det i huvudsak tätbebyggt. Runt Penápolis är det ganska tätbefolkat, med 83 invånare per kvadratkilometer. Klimatet i området är fuktigt och subtropiskt. Årsmedeltemperaturen i trakten är 24 °C. Den varmaste månaden är november, då medeltemperaturen är 27 °C, och den kallaste är juli, med 20 °C. Genomsnittlig årsnederbörd är 1,530 millimeter. Den regnigaste månaden är januari, med i genomsnitt 213 mm nederbörd, och den torraste är augusti, med 1 mm nederbörd.